Valo- ja elektronimikroskoopin väliset erot havaitaan.
Optisen mikroskoopin ja elektronimikroskoopin ero on siinä, että optisella mikroskoopilla voidaan nähdä vain tiettyjä solurakenteita, kuten soluseinämiä, kloroplasteja, värjäytyneitä kromosomeja, mitokondrioita, ytimiä jne. pieniä organelleja. Lyhyesti sanottuna valomikroskoopilla voidaan nähdä solujen mikroskooppinen rakenne ja elektronimikroskoopilla submikroskooppinen rakenne.
Suurin ero on suurennus. Optisilla mikroskoopeilla on suurennusraja, ja riippumatta siitä, kuinka suuri zoom on, ihmissilmä ei pysty erottamaan sitä. y(min)=0.61*aallonpituus)/(n*sinu) —— Vaikka n*sinu olisi upotettu öljyyn, maksimi on noin 1,5 ja loppu riippuu aallonpituuden koosta. Siksi optisen mikroskoopin maksimi on noin 1000-kertainen, eikä sitä ole hyödytöntä zoomata. Elektronimikroskoopit käyttävät kuvantamiseen elektronisäteitä ja aallonpituus on paljon pienempi kuin näkyvän valon, joten pienin resoluutioetäisyys y(min) on paljon pienempiä ja pienempiä yksityiskohtia voidaan selvittää, ja suurennus voi olla useita miljoonia.
