1. Erilaiset valonlähteet
Mikroskoopissa käytetty valonlähde on elektronipistoolin lähettämä elektronivirta ja optisen mikroskoopin valonlähde on näkyvä valo (auringonvalo tai valo). Koska osavirran aallonpituus on paljon lyhyempi kuin valoaallon aallonpituus, elektronimikroskoopin suurennos ja resoluutio ovat merkittävästi korkeammat kuin valopeilin. .
2. Erilaiset linssit
Elektronimikroskoopissa suurentava objektiivi on sähkömagneettinen linssi (renkaan muotoinen sähkömagneettinen kela, joka voi luoda magneettikentän keskelle), ja optisen mikroskoopin objektiivi on lasista valmistettu optinen linssi. Elektronimikroskoopeissa on kolme ryhmää sähkömagneettisia linssejä, jotka vastaavat kondensaattoriobjektiivin ja okulaarin toimintoja optisissa mikroskoopeissa.
3. Erilaiset kuvantamisperiaatteet
Elektronimikroskoopissa tarkastettavaan näytteeseen vaikuttava elektronisuihku suurennetaan sähkömagneettisella linssillä ja osuu sitten fluoresoivaan näyttöön kuvantamista varten tai vaikuttaa valoherkkään kalvoon kuvantamista varten. Elektronitiheyseron mekanismi on se, että kun elektronisuihku vaikuttaa testattavaan näytteeseen, tulevat elektronit törmäävät aineen atomien kanssa muodostaen sironnan ja näytteen eri osissa elektronien sirontaaste on erilainen. joten näytteen elektronikuva esitetään sävyinä. Näytteen kohdekuva optisessa mikroskoopissa esitetään kirkkauserolla, joka johtuu erosta näytteen eri rakenteiden absorboiman valon määrässä.
4. Resoluutio
Valon interferenssin ja diffraktion vuoksi optisten mikroskooppien resoluutio voidaan rajoittaa vain arvoon 02-05um. Koska elektronimikroskoopit käyttävät elektronisuihkuja valonlähteinä, vikanopeus voi olla 1-3 nm. Siksi optisten mikroskooppien kudoshavainnointi kuuluu mikronitason analyysiin ja elektronimikroskooppien kudoshavainnointi nanotason analyysiin.
5. Syvyysterävyys
Yleensä optisen mikroskoopin syväterävyys on välillä 2-3um, joten näytteen pinnan sileys on erittäin vaativa, joten näytteen valmistusprosessi on suhteellisen monimutkainen. SEM:n henki voi olla jopa useita metrejä, joten näytteen pinnan geometrian sileydelle ei ole vaatimusta, näytteen valmistus on suhteellisen yksinkertaista, ja jotkut näytegeometriat eivät vaadi näytteen valmistelua. Stereomikroskoopeilla on suhteellisen suuri syväterävyys, mutta niiden resoluutio on erittäin alhainen.
6. Käytetään erilaisia näytteenkäsittelymenetelmiä
Submikroskooppiseen havainnointiin käytettävien kudos- ja solunäytteiden valmistusprosessi on monimutkainen, teknisesti vaikea ja kallis. Näytteenoton, kiinnityksen, dehydratoinnin ja upottamisen vaiheissa tarvitaan erityisreagensseja ja -toimenpiteitä. Lopuksi upotetut kudoslohkot on laitettava ultramikroatomiin leikataksesi ultraohuiksi näytteiksi, joiden paksuus on 50–100 nm. Valomikroskopialla havaitut näytteet asetetaan yleensä lasilevyille, kuten tavalliset kudosviipanäytteet, solunäytteet, kudospuristetut näytteet ja solupisaranäytteet.
7. Suurennus
Optisen mikroskoopin tehollinen suurennus on 1000X. Hyvän sähkömikroskoopin tehollinen suurennus voi olla 1000 000X.






